長治醫學院醫學檢驗專業于2001年5月經國家教育部批準設立，同年成立醫學檢驗系，開始招收第一屆醫學檢驗專業五年制本科生。本著高起點、高標準、立足山西、面向全國的辦系理念，依托學院、附屬和平醫院、附屬和濟醫院雄厚的教學資源和師資力量，吸收和借鑒國內外知名院校醫學檢驗系的辦學經驗，在學院優先扶持、重點投入、大力支持下，經過17年時間的建設與發展，已完成了前期預定的發展規劃，辦學條件完善，辦學質量良好，各項工作步入了快速發展軌道。

2012年教育部修訂本科專業目錄，將“醫學檢驗專業”改為“醫學檢驗技術專業”，學制由五年制調整為四年制。學位由發醫學學士學位改為發理學學士學位，2013年起醫學檢驗技術專業改招四年制本科生。醫學檢驗系現已形成全日制普通高等教育四年制本科、高職專升本、成人教育三年制業余專升本的多層次學歷教育，現有全日制普通本科生和高職專升本532人，成人教育專升本科（業余）約60人。生源地以山西省為主，此外還有河北、湖南、天津、山東、遼寧、湖北、黑龍江、海南、甘肅、貴州、內蒙古等全國20多個省市區。

醫學檢驗系設有臨床生物化學檢驗、臨床血液學檢驗、臨床基礎檢驗、臨床病原生物學檢驗、臨床免疫學檢驗五個專業教研室和一個臨床檢驗實驗中心......