數學系現有教師21人，其中具有正高級職稱3名，副高級職稱8人、講師10人，博士7人。數學系現有數學與應用數學1個本科專業，本專業按數學與應用數學大類招生，下設計算金融學，計算生物學兩個方向，均為隨計算機技術發展形成的新興學科方向。專業主要培養具有良好的科學素養，掌握數學科學的基本理論和原理，能運用現代數學方法和計算機技術從事研究、開發和實際應用的中高級復合型科學技術人才，專業跨度大，理論基礎扎實，就業適應面廣。
數學系下設云南農業大學大學計算金融研究中心，研究中心主要研究金融大數據與智能決策支持技術、計算金融與風險管理，涉及金融數學、金融工程、計算機技術、量化投資與高頻交易等學科領域，通過學科交叉，融合創新。中心以數學與應用數學本科專業計算金融方向為平臺，每年擬招收60名左右的本科生。研究中心現有計算金融研究團隊緊密跟蹤金融學前沿研究方法，立足于中國的金融市場，已開展了一系列研究。研究團隊在公司金融、金融風險計量與控制等方面的研究具有鮮明的特色。近年來，在學術研究方面，團隊已主持或參與國家基金9項，教育部基金2項，省基金4項，地廳級基金8項，在國內外重要的學術期刊上發表高水平論文80余篇（其中SCI、EI收錄20余篇）、出版專著1部，教材6部。
         多年來數學系主要承擔數學與應用數學專業人才培養外，還承擔全校理學、工學、農學、經管類等專業相應數學課程，完成學校精品課程建設1門、重點課程建設3門、主持校級一類課程5門，現有主編、參編教材13部，自主開發學習平臺軟件專利1項，發表教學科研文章100余篇，專業成立以來每年均組織學生參加全國大學生數學建模大賽，獲多項國家級省級獎項。