中山大學農學教育具有悠久的辦學歷史。1924年，孫中山先生在創建“國立廣東大學”之初，就成立了“農科學院”，1926年更名為“國立中山大學農科學院”。著名農學家丁穎教授、鄧植儀教授、沈鵬飛教授等均曾在中山大學農學院任教，為我國農業研究和教育培養了一大批優秀人才。1952年全國高校院系調整時，農學院從中山大學調出，分別并入華南農學院、華中農業大學。
為適應我國現代農業發展需要，服務于國家鄉村振興戰略，保障國家糧食安全和農業可持續發展，中山大學于2018年8月成立農學院，復辦整建制農學教育。目前，農學院在廣州校區過渡辦學，計劃2020年或2021年遷駐深圳校區。
農學院以“農穩社稷，糧安天下”為己任，秉持“匯世界精英，育天下英才”的理念，圍繞立德樹人的人才培養目標和“雙一流”建設的戰略發展目標，構建以現代生物技術為主體，融合信息技術和工程技術的新農科，打造具有南方現代農業特色的世界一流農學院。